MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC01

Total Repeats: 806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015420	TAAA	2	8	109	116	75 %	25 %	0 %	0 %	330818918
2	NC_015420	TGG	2	6	247	252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818918
3	NC_015420	GTG	2	6	253	258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818918
4	NC_015420	TTA	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818918
5	NC_015420	TGG	2	6	321	326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818918
6	NC_015420	GTT	2	6	399	404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818918
7	NC_015420	TTCAGT	2	12	415	426	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330818918
8	NC_015420	GCT	2	6	430	435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818918
9	NC_015420	GGC	2	6	444	449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330818918
10	NC_015420	TCA	2	6	509	514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818918
11	NC_015420	ACA	2	6	611	616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818918
12	NC_015420	CAG	2	6	651	656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818918
13	NC_015420	CTT	2	6	707	712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818918
14	NC_015420	CTT	2	6	752	757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818918
15	NC_015420	AAGT	2	8	784	791	50 %	25 %	25 %	0 %	330818918
16	NC_015420	AAG	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818918
17	NC_015420	AGT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818918
18	NC_015420	CAG	2	6	938	943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818918
19	NC_015420	GTT	2	6	976	981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818918
20	NC_015420	AACG	2	8	1087	1094	50 %	0 %	25 %	25 %	330818918
21	NC_015420	TTA	2	6	1114	1119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818918
22	NC_015420	AGC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818918
23	NC_015420	GGT	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818918
24	NC_015420	TTCA	2	8	1275	1282	25 %	50 %	0 %	25 %	330818918
25	NC_015420	AAATT	2	10	2632	2641	60 %	40 %	0 %	0 %	330818919
26	NC_015420	T	7	7	2662	2668	0 %	100 %	0 %	0 %	330818919
27	NC_015420	AGC	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818919
28	NC_015420	AGT	2	6	2684	2689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818919
29	NC_015420	CGCT	2	8	2713	2720	0 %	25 %	25 %	50 %	330818919
30	NC_015420	AGC	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818919
31	NC_015420	AAT	2	6	2874	2879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818919
32	NC_015420	TTG	2	6	2899	2904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818919
33	NC_015420	TCA	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818919
34	NC_015420	CG	3	6	2998	3003	0 %	0 %	50 %	50 %	330818919
35	NC_015420	AGA	2	6	3046	3051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818919
36	NC_015420	TTG	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818919
37	NC_015420	ATT	2	6	3284	3289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818920
38	NC_015420	GAT	2	6	3311	3316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818920
39	NC_015420	A	6	6	3363	3368	100 %	0 %	0 %	0 %	330818920
40	NC_015420	AGA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818920
41	NC_015420	ATG	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818920
42	NC_015420	GTTT	2	8	3538	3545	0 %	75 %	25 %	0 %	330818920
43	NC_015420	TGC	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818920
44	NC_015420	ATG	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818920
45	NC_015420	TTA	2	6	3632	3637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818920
46	NC_015420	AAG	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818920
47	NC_015420	GTC	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818920
48	NC_015420	GGCGT	2	10	3675	3684	0 %	20 %	60 %	20 %	330818920
49	NC_015420	GTG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818920
50	NC_015420	CCA	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818920
51	NC_015420	A	6	6	3832	3837	100 %	0 %	0 %	0 %	330818920
52	NC_015420	AAAAG	2	10	3842	3851	80 %	0 %	20 %	0 %	330818920
53	NC_015420	A	6	6	3995	4000	100 %	0 %	0 %	0 %	330818921
54	NC_015420	TCC	2	6	4103	4108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330818921
55	NC_015420	TC	3	6	4121	4126	0 %	50 %	0 %	50 %	330818921
56	NC_015420	TCA	2	6	4140	4145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818921
57	NC_015420	A	6	6	4217	4222	100 %	0 %	0 %	0 %	330818921
58	NC_015420	TGA	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818921
59	NC_015420	ATG	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818922
60	NC_015420	T	6	6	4420	4425	0 %	100 %	0 %	0 %	330818922
61	NC_015420	TTAGC	2	10	4475	4484	20 %	40 %	20 %	20 %	330818922
62	NC_015420	AGTT	2	8	4551	4558	25 %	50 %	25 %	0 %	330818922
63	NC_015420	GTTT	2	8	4595	4602	0 %	75 %	25 %	0 %	330818922
64	NC_015420	TGC	2	6	4626	4631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818922
65	NC_015420	AAG	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818922
66	NC_015420	TGC	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818922
67	NC_015420	TAT	2	6	4800	4805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818922
68	NC_015420	TGC	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818922
69	NC_015420	GTG	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818922
70	NC_015420	CGA	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818922
71	NC_015420	ACA	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818922
72	NC_015420	ACT	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818922
73	NC_015420	CAG	2	6	5260	5265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818922
74	NC_015420	TGT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818922
75	NC_015420	GAA	2	6	5325	5330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818922
76	NC_015420	A	7	7	5347	5353	100 %	0 %	0 %	0 %	330818922
77	NC_015420	AAC	2	6	5388	5393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818922
78	NC_015420	GCT	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818922
79	NC_015420	TGA	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818922
80	NC_015420	ACT	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818922
81	NC_015420	ATG	2	6	5591	5596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818922
82	NC_015420	CGT	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818922
83	NC_015420	AAG	2	6	5762	5767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818922
84	NC_015420	TGG	2	6	5935	5940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818922
85	NC_015420	AAT	2	6	6043	6048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818922
86	NC_015420	A	6	6	6083	6088	100 %	0 %	0 %	0 %	330818922
87	NC_015420	TAAT	2	8	6103	6110	50 %	50 %	0 %	0 %	330818922
88	NC_015420	T	6	6	6157	6162	0 %	100 %	0 %	0 %	330818923
89	NC_015420	ATT	3	9	6186	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818923
90	NC_015420	TGGA	2	8	6225	6232	25 %	25 %	50 %	0 %	330818923
91	NC_015420	TGG	2	6	6240	6245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818923
92	NC_015420	ATT	2	6	6258	6263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818923
93	NC_015420	GTG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818923
94	NC_015420	TAT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818923
95	NC_015420	T	6	6	6376	6381	0 %	100 %	0 %	0 %	330818923
96	NC_015420	GCC	2	6	6388	6393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818923
97	NC_015420	ACC	2	6	6448	6453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818923
98	NC_015420	CGT	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818923
99	NC_015420	TGC	2	6	6468	6473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818923
100	NC_015420	ATG	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818923
101	NC_015420	GCT	2	6	6493	6498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818923
102	NC_015420	TGA	2	6	6546	6551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818923
103	NC_015420	TAT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818923
104	NC_015420	CTT	2	6	6602	6607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818923
105	NC_015420	T	6	6	6652	6657	0 %	100 %	0 %	0 %	330818923
106	NC_015420	GTA	2	6	6719	6724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818923
107	NC_015420	GTC	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818923
108	NC_015420	TCC	2	6	6848	6853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330818923
109	NC_015420	ATTG	2	8	6855	6862	25 %	50 %	25 %	0 %	330818923
110	NC_015420	TAG	2	6	6870	6875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818923
111	NC_015420	AAG	2	6	6945	6950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818923
112	NC_015420	GTAT	2	8	7016	7023	25 %	50 %	25 %	0 %	330818923
113	NC_015420	AAC	2	6	7056	7061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818923
114	NC_015420	ATT	2	6	7062	7067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818923
115	NC_015420	GGT	2	6	7096	7101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818923
116	NC_015420	TGC	2	6	7107	7112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818923
117	NC_015420	ATGGGC	2	12	7117	7128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330818923
118	NC_015420	AGC	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818923
119	NC_015420	ATCA	2	8	7191	7198	50 %	25 %	0 %	25 %	330818923
120	NC_015420	CATC	2	8	7221	7228	25 %	25 %	0 %	50 %	330818923
121	NC_015420	GTT	2	6	7392	7397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818923
122	NC_015420	A	7	7	7483	7489	100 %	0 %	0 %	0 %	330818924
123	NC_015420	TGT	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818924
124	NC_015420	AAC	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818924
125	NC_015420	TCG	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818924
126	NC_015420	TTG	2	6	7667	7672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818924
127	NC_015420	ATGG	2	8	7720	7727	25 %	25 %	50 %	0 %	330818924
128	NC_015420	TAG	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818924
129	NC_015420	ATG	2	6	7835	7840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818925
130	NC_015420	ATTT	2	8	7847	7854	25 %	75 %	0 %	0 %	330818925
131	NC_015420	A	7	7	7904	7910	100 %	0 %	0 %	0 %	330818925
132	NC_015420	ATT	2	6	8040	8045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818925
133	NC_015420	CCA	2	6	8108	8113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818925
134	NC_015420	AGC	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818925
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251	NC_015420	T	7	7	18273	18279	0 %	100 %	0 %	0 %	330818931
252	NC_015420	A	6	6	18281	18286	100 %	0 %	0 %	0 %	330818931
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256	NC_015420	AAAC	2	8	19133	19140	75 %	0 %	0 %	25 %	330818932
257	NC_015420	ATT	2	6	19281	19286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818932
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260	NC_015420	CCA	2	6	19443	19448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818932
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262	NC_015420	ACT	2	6	19489	19494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818932
263	NC_015420	TAT	2	6	19496	19501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818932
264	NC_015420	TGAT	2	8	19567	19574	25 %	50 %	25 %	0 %	330818932
265	NC_015420	TTG	2	6	19597	19602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818932
266	NC_015420	TGG	2	6	19628	19633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818932
267	NC_015420	ATG	2	6	19729	19734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818932
268	NC_015420	GAA	2	6	19857	19862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818932
269	NC_015420	A	6	6	19867	19872	100 %	0 %	0 %	0 %	330818932
270	NC_015420	A	6	6	19890	19895	100 %	0 %	0 %	0 %	330818933
271	NC_015420	TCT	2	6	19932	19937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818933
272	NC_015420	TCAA	2	8	20003	20010	50 %	25 %	0 %	25 %	330818933
273	NC_015420	A	9	9	20028	20036	100 %	0 %	0 %	0 %	330818933
274	NC_015420	AAAG	2	8	20061	20068	75 %	0 %	25 %	0 %	330818933
275	NC_015420	CCA	2	6	20103	20108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818933
276	NC_015420	GAG	2	6	20109	20114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330818933
277	NC_015420	GAAAA	2	10	20121	20130	80 %	0 %	20 %	0 %	330818933
278	NC_015420	TCT	2	6	20141	20146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818933
279	NC_015420	AAT	2	6	20184	20189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818933
280	NC_015420	TGA	2	6	20343	20348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818934
281	NC_015420	ATTA	2	8	20369	20376	50 %	50 %	0 %	0 %	330818934
282	NC_015420	TGC	2	6	20384	20389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818934
283	NC_015420	TCA	2	6	20397	20402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818934
284	NC_015420	GAA	2	6	20435	20440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818934
285	NC_015420	ATGG	2	8	20494	20501	25 %	25 %	50 %	0 %	330818934
286	NC_015420	GTT	2	6	20781	20786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818934
287	NC_015420	GTT	2	6	20791	20796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818934
288	NC_015420	AGCC	2	8	20889	20896	25 %	0 %	25 %	50 %	330818934
289	NC_015420	TGC	2	6	21002	21007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818934
290	NC_015420	ACG	2	6	21020	21025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818934
291	NC_015420	ATT	2	6	22116	22121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818935
292	NC_015420	CGG	2	6	22147	22152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330818935
293	NC_015420	AAGC	2	8	22197	22204	50 %	0 %	25 %	25 %	330818935
294	NC_015420	AGC	2	6	22401	22406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818935
295	NC_015420	TCC	2	6	22747	22752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330818935
296	NC_015420	TC	3	6	22780	22785	0 %	50 %	0 %	50 %	330818935
297	NC_015420	AG	4	8	22814	22821	50 %	0 %	50 %	0 %	330818935
298	NC_015420	TGGC	2	8	22942	22949	0 %	25 %	50 %	25 %	330818935
299	NC_015420	T	7	7	23697	23703	0 %	100 %	0 %	0 %	330818936
300	NC_015420	TGGCC	2	10	23786	23795	0 %	20 %	40 %	40 %	330818936
301	NC_015420	TTG	2	6	23813	23818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818936
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303	NC_015420	TGTTT	2	10	23885	23894	0 %	80 %	20 %	0 %	330818936
304	NC_015420	TTGGCT	2	12	24219	24230	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330818937
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306	NC_015420	AGGA	2	8	24266	24273	50 %	0 %	50 %	0 %	330818937
307	NC_015420	ATA	2	6	24327	24332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818937
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319	NC_015420	GTC	2	6	25243	25248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818938
320	NC_015420	TCGA	2	8	25287	25294	25 %	25 %	25 %	25 %	330818938
321	NC_015420	TAA	2	6	25302	25307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818938
322	NC_015420	ATC	2	6	25381	25386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818938
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324	NC_015420	TAG	2	6	25532	25537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818938
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330	NC_015420	TGA	2	6	26165	26170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818939
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332	NC_015420	GTA	2	6	26224	26229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818939
333	NC_015420	TA	3	6	26272	26277	50 %	50 %	0 %	0 %	330818939
334	NC_015420	AGG	2	6	26321	26326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330818939
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344	NC_015420	TCA	2	6	26894	26899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818940
345	NC_015420	AGT	2	6	26950	26955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818940
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348	NC_015420	TGA	2	6	27071	27076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818940
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359	NC_015420	ACCA	2	8	27508	27515	50 %	0 %	0 %	50 %	330818940
360	NC_015420	ACTT	2	8	27526	27533	25 %	50 %	0 %	25 %	330818940
361	NC_015420	AGC	3	9	27547	27555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818940
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363	NC_015420	TCA	2	6	27696	27701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818940
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365	NC_015420	TTG	2	6	27845	27850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818941
366	NC_015420	T	6	6	27917	27922	0 %	100 %	0 %	0 %	330818941
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370	NC_015420	GCT	2	6	28325	28330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818941
371	NC_015420	TAG	2	6	28442	28447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818941
372	NC_015420	GA	3	6	28507	28512	50 %	0 %	50 %	0 %	330818941
373	NC_015420	GATA	2	8	28636	28643	50 %	25 %	25 %	0 %	330818941
374	NC_015420	GAT	2	6	28686	28691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818941
375	NC_015420	TAA	2	6	28718	28723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818941
376	NC_015420	ATT	2	6	28835	28840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818942
377	NC_015420	AAT	2	6	28848	28853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818942
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379	NC_015420	CTT	2	6	28910	28915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818942
380	NC_015420	GCC	2	6	28929	28934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818942
381	NC_015420	AGC	2	6	28935	28940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818942
382	NC_015420	T	6	6	28968	28973	0 %	100 %	0 %	0 %	330818942
383	NC_015420	CAC	2	6	29000	29005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818942
384	NC_015420	TTG	2	6	29006	29011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818942
385	NC_015420	CAA	2	6	29054	29059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818942
386	NC_015420	CAG	2	6	29063	29068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818942
387	NC_015420	TAA	2	6	29091	29096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818942
388	NC_015420	TTAA	2	8	29116	29123	50 %	50 %	0 %	0 %	330818942
389	NC_015420	TTA	2	6	29131	29136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818942
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391	NC_015420	AAC	2	6	29148	29153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818942
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